同构实验室的下一代IsoDDE引擎推动AI驱动的复杂且难以靶向分子设计

简要介绍

IsoDDE 被认为是下一代人工智能平台，旨在通过提高预测准确性、扩大靶点覆盖范围以及创造新型化学物质，推动复杂生物系统的计算机药物发现。

同构实验室（Isomorphic Labs）是谷歌DeepMind的一个分支机构，已于2026年2月推出IsoDDE，被描述为迄今为止公开披露的最先进的计算药物设计人工智能系统。

该平台定位为一个完整的循环式计算引擎，超越了AlphaFold 3的结构预测焦点，旨在解决数字药物开发流程中长期存在的多个限制。

据公司介绍，IsoDDE设计为能够泛化到未知的生物系统，预测结合亲和力而无需依赖传统的物理模拟，识别隐藏的调控口袋，并能有效与抗体及其他复杂生物大分子协作。

在内部项目中，同构实验室报告称，IsoDDE已被用来解析先前未表征的结构，检测未经过实验注释的口袋，并为难以药物化的靶点生成新型化学物质。该系统被呈现为一个统一的计算框架，旨在弥合结构预测与实际药物设计任务之间的差距，提供的准确性水平据称超越早期的深度学习和物理基础方法。

该平台的开发是在2024年AlphaFold 3发布后，人工智能驱动的分子建模快速发展的基础上进行的。虽然该模型显著推进了蛋白-配体结构预测，但尚未完全解决将计算方法应用到实际药物发现流程中的挑战——即模型必须处理多样的生化性质，并能外推到训练分布之外的系统。IsoDDE旨在通过提供一个可扩展的基础，导航未被探索的生物和化学空间，从而弥补这一空白。

同构实验室表示，IsoDDE已在与主要制药公司的合作中实现集成，平台负责进行计算设计和预测，而合作伙伴则进行实验验证和临床开发。公司也持续扩大其内部研发管线。在2025年至2026年期间，获得了大量投资，包括2025年3月的6亿美元融资，并正准备多个自主研发的分子——主要用于肿瘤学——进入临床试验。

IsoDDE被视为下一代计算引擎，旨在提升预测准确性、拓展可药物化靶点的范围，并加快从分子建模到经过实验验证的治疗候选物的转化速度。

IsoDDE在人工智能驱动药物设计中树立新标杆

IsoDDE被描述为在预测准确性和功能范围方面的重大突破，提供了对调控人类生物学的分子系统的更详细理解，并改善了影响这些系统的化合物的计算设计。

在同构实验室的持续研究项目中，平台被常规用于解析未曾表征的结构、检测未被实验识别的口袋，以及为具有挑战性的治疗靶点生成新型化学物质。

公司指出，未来将继续推动计算药物设计的边界，旨在将这些增强的能力应用于历史上难以攻克的药物发现领域。