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去中心化分布式存储的发展也面临一些挑战：

· 技术成熟度与性能：大规模数据检索的速度、稳定性以及数据的动态修复能力仍需优化。例如，硬盘年故障率约3%，若文件分100片存储，单点故障可能导致整体不可用的理论失效率会放大100倍。不过，像动态检测、自动修复机制（如MEMO的RAFI）等技术正在努力解决这些问题。
· 经济模型的可持续性：如何设计良好的代币经济模型，有效激励存储提供方长期稳定地存储数据，而非追求短期代币收益，是一个关键问题。需要平衡存储需求方（要求长期可用性）与提供方（追求短期收益）的目标冲突。
· 监管与合规问题：数据的不可篡改性和抗审查性是一把双刃剑，也可能被用于存储非法内容。如何在保持去中心化优势的同时，符合不同国家地区的法律法规（如GDPR数据遗忘权），是需要探索的难题。
· 用户体验与市场教育：对普通用户而言，私钥管理、与区块链交互等操作仍有一定门槛。市场（包括个人和企业用户）对去中心化存储的认知和信任度仍需培养。